棚室西紅柿一般采用單稈整枝，只留一個主稈，所有側枝全部疏除。打側枝要選晴天上午進行，這樣利于傷口愈合。當第一穗果綠熟(果實長到最大，果頂由綠變白)時，除去第一穗果下的老葉，第二穗果綠熟時，除去第二穗果下的老葉，以此類推，這樣利于通風透光，減少養分無效消耗，防止病害蔓延。秋延后栽培的當主稈第五穗果開花后，在果穗上方留2~3片葉摘心。越冬茬栽培的等主稈結到6~7穗果后，在果穗上方留2~3片葉摘心，并在稈上開始預留側枝。當主稈上果實采收完后，如果每一株西紅柿都產生了側枝，則在基部選留一個健壯側枝，把它上面的老枝剪去。如果某一株沒有產生側枝，則把這一株西紅柿放倒，在它旁邊的植株上選留兩個側枝，一個側枝用該植株的吊繩吊起生長，另一側枝用無側枝的植株的吊繩吊起生長。第二茬又可結5~6層果實。